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molecule editor

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发表于 1970-1-1 08:00:00 显示全部楼层 |阅读模式
aspen求助
aspen版本: V9
本帖最后由 wx_G8V88383 于 2017-8-10 19:16 编辑

aspen中使用molecule editor画出的过硫酸铵很丑(本来是没有的),我想问,我画的这个会影响真实情况下的键长键角?影响后面的计算,还是说我要Calculate Bonds?我两个都试了,对于目前我的模拟没有减少warning,所以还是想请教下前辈们,恳请前辈不吝赐教。谢!

QQ截图20170604221540.png

发表于 1970-1-1 08:00:00 显示全部楼层
这里难道也要看颜值?
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发表于 1970-1-1 08:00:00 显示全部楼层
这个只能画共价键的物质,主要是有机物。
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 楼主| 发表于 1970-1-1 08:00:00 显示全部楼层
imeagor 发表于 2017-6-5 16:19
这里难道也要看颜值?

哈哈~对的!不用,请问有可以自动“美化”的方法吗?换言之,如果不美化,会影响到后面的物性的吗?
molecule editor我没有找到专门介绍的资料,比较懵~
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 楼主| 发表于 1970-1-1 08:00:00 显示全部楼层
Horse 发表于 2017-6-5 16:30
这个只能画共价键的物质,&#20 ...

对的,我看绝大多数aspen内置文件都是有机物
但是很奇怪,我从find中查找到过硫酸铵这种物质,但是在molecule editor中却看不见他的structure,再加上后面出现物性错误,所以我贸然画了一个过硫酸铵的结构。
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发表于 1970-1-1 08:00:00 显示全部楼层
硫酸铵这个东西数据库自带的,你干嘛还要自己定义
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 楼主| 发表于 1970-1-1 08:00:00 显示全部楼层
imeagor 发表于 2017-6-6 09:47
硫酸铵这个东西数据库自带的,你干嘛还要自己定义

抱歉,我问一个非常愚蠢的问题。
KI和过硫酸铵在数据库里面都有,但是在结构里面却只有KI的结构式,请问这是为什么?

点评

很抱歉,这个我们有注意过,我只在自定义物质时候才去关心结构  详情 回复 发表于 2017-6-9 10:20
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发表于 1970-1-1 08:00:00 显示全部楼层
wx_G8V88383 发表于 2017-6-8 14:08
抱歉,我问一个非常愚蠢的问题。
KI和过硫酸铵在数据库里面都有,但是在结构里面却只有KI的结构式,请问 ...

很抱歉,这个我们有注意过,我只在自定义物质时候才去关心结构
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 楼主| 发表于 1970-1-1 08:00:00 显示全部楼层
imeagor 发表于 2017-6-9 10:20
很抱歉,这个我们有注意过,我只在自定义物质时候才去关心结构

确实,我现在就在自定义
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