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用1分钟绘制、输入分子结构的方法(以精胺为例)

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发表于 1970-1-1 08:00:00 显示全部楼层 |阅读模式
本帖最后由 banknation 于 2020-3-2 13:29 编辑

   
  1分钟绘制、输入分子结构的方法(以精胺为例)


    在网上下载分子结构,心里都没有把握,用 Aspen Plus 中绘制又有些不方便,如果输入不标准,系统会错误识别。

    ChemDraw 专业软件是比较好的选择,下面讲解用该软件 快速绘制分子结构 的方法

1.PNG

    启动 ChemDraw,在 View 下拉菜单选中 Show Structure Toolbar,调出该工作窗口
2.PNG

    在 Show Structure Toolbar 窗口里选择第一项(Name to Structure)
3.PNG

  在弹出的表单中填写要绘制的化合物名称(英文),例如: spermine( 精胺 ),OK
4.PNG

5.PNG

  删除分子结构下面的 spermine !!!另存为 MOL.Molfile(*.mol)类型文件
6.PNG

  系统提示:这并不是你用本软件绘制,不一定能使用。不理它,点击 OK !
7.PNG

  软件在你指定位置,生成 spermine.mol 文件

  启动 Aspen Plus,输入组分:spermine,由于数据库没有资料,所以后面是空白
8.PNG

   选择物性方法     注意:此步不可省略,否则分子结构无法输入)

   进入组分—分子结构—SPERMINE”,选择“结构与功能组”标签,点击“绘图/导入/编辑”按钮,进入绘制界面
9.PNG

  打开 spermine.mol 文件
10.PNG

   点击右上角的 X,即出编辑状态,分子结构被写入系统
11.PNG

  单击“计算氢键”按钮,系统自动完成结构统计、计算,返回“常规”标签查看结果
12.PNG

  分子结构已经成功录入系统,下面就能对精胺(spermine)进行物性估算了

  上述过程,熟练者只需1分钟就能完成,OK !



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我觉得ASPEN自带的绘制还是挺好用的
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